O cancelamento de NFC-e somente pode ocorrer depois da emissão deste documento fiscal, em que ainda não tenha ocorrido a saÃda da mercadoria do estabelecimento.
Sabendo disso, acesse o menu lateral Fiscal, submenu NFC-e emitidas.
Em seguida, selecione a NFC-e deseja, clique em Mais Ações e após, em Cancelar NFCe.
Assim, o sistema apresentará uma tela para que seja informado o motivo do cancelamento da NFC-e, onde você deverá descrevê-lo no campo Justificativa do Cancelamento. Feito isso, clique na opção Enviar Cancelamento de Nota a SEFAZ, no topo da tela.
Dessa forma, o cancelamento será repassado à Fazenda e o sistema apresentará o status desta NFC-e como NFe Cancelada.